L’interno – molto sobrio e con pochi elementi decorativi – conserva tracce e reperti scultorei dell’antica chiesa primitiva, nonché alcuni affreschi tra i quali, nella seconda colonna di destra, uno raffigurante San Colombano benedicente e databile al XV secolo.
Un altro affresco, riportato alla luce dagli interventi di restauro del 1994, è dipinto sulla parete della navata minore e riproduce La presentazione di Gesù al tempio; vi si riconoscono – oltre al sacerdote, Gesù, Giuseppe e Maria – i santi Francesco d’Assisi e Lorenzo.
Sulla parete absidale della navata destra è conservato invece un polittico con Scene della passione di Gesù.